當(dāng)前，以PacBio、Nanopore為代表的三代測序技術(shù)已成為全基因組測序（WGS）的主流方法。利用無需PCR過程的單分子測序技術(shù)，進(jìn)行長讀長測序，無論是對基因組組裝還是基因組變異檢測，都具有很高的準(zhǔn)確率。更可利用測序過程中聚合酶反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)變化，分析基因組學(xué)和表觀遺傳學(xué)數(shù)據(jù)，適合于基于多組學(xué)研究的應(yīng)用場景。

結(jié)合當(dāng)前大力發(fā)展中醫(yī)藥研究及產(chǎn)業(yè)化的時(shí)代大背景，基于全基因組測序及多組學(xué)研究的技術(shù)，已經(jīng)成為了中醫(yī)藥科學(xué)研究的重要推動(dòng)力。日前，來自醫(yī)科大學(xué)、中醫(yī)科學(xué)院道地藥材重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、以及安諾優(yōu)達(dá)的聯(lián)合團(tuán)隊(duì)利用PacBio三代測序技術(shù)，發(fā)表了一個(gè)染色體水平的高質(zhì)量三七參考基因組，并通過基因組演化分析，鑒定了系統(tǒng)發(fā)育與全基因組復(fù)制事件對于皂苷合成的影響。

三七是五加科人參屬的多年生草本植物，因其廣泛的藥理學(xué)作用，在中國近千年的臨床治療中發(fā)揮了重要的作用。結(jié)合多組學(xué)研究數(shù)據(jù)，研究人員還對三七進(jìn)行了詳細(xì)的轉(zhuǎn)錄水平分析，揭示了三七的小塊莖形成的基因調(diào)控機(jī)制，從時(shí)間和空間水平上，進(jìn)一步研究了皂苷的合成和調(diào)控。鑒定到了5個(gè)糖基轉(zhuǎn)移酶基因，在三七中催化不同的人參皂苷的形成。

文章中所報(bào)道的三七全基因組數(shù)據(jù)為將來進(jìn)一步研究三七生長特性、栽培、育種以及皂苷合成提供了遺傳數(shù)據(jù)資源。這一成果發(fā)表于核心期刊《Plant Communications》。

三代全基因組測序?qū)蚪MDNA的濃度、純度有較高要求，只有質(zhì)量合格的樣品才能進(jìn)入測序流程，否則將導(dǎo)致錯(cuò)誤的產(chǎn)生。   

本文中樣品質(zhì)控使用了Implen的Nanophotometer?及Qubit 2.0，分別對提取的基因組DNA進(jìn)行純度及濃度檢測。A260/A280、A260/A230方法為核酸樣品質(zhì)控的通用方法，同時(shí)也是目前的標(biāo)準(zhǔn)方法。Nanophotometer?可以準(zhǔn)確的測量A260/A280和A260/A230，提供完整的DNA純度數(shù)據(jù)，完全符合期刊對于數(shù)據(jù)完整性的要求。

這得益于設(shè)備高精度的光學(xué)結(jié)構(gòu)，在全波長掃描下可同時(shí)獲得全波長數(shù)據(jù)。無論是NGS，三代測序，還是QPCR，DNA還是RNA，Nanophotometer?都可以令您得心應(yīng)手，助力您的科學(xué)研究。

如果您使用基因測序作為研究手段，可根據(jù)通量需求選擇Implen的N60或N120系列，實(shí)現(xiàn)對少量或大量核酸樣本的質(zhì)控。N60作為單通道設(shè)備，性能出眾，操作便捷；N120可一次測量12個(gè)樣品，得到準(zhǔn)確結(jié)果。二者均具有很好的波長精度，適合多波長測量下的比值數(shù)據(jù)獲取。

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